Povezovanje farmacevtov, ki se je začelo že leta 1945, je dobilo pravno-formalno podlago za ustanovitev samostojnega društva farmacevtov leta 1950. Leta 1961 so se društvu pridružili tudi farmacevtski tehniki. Od vsega začetka se člani znotraj društva združujejo v podružnice po regionalnem načelu in v sekcije po strokovnem interesu. Danes aktivnosti potekajo v 9 podružnicah in 12 sekcijah.

Od leta 1975 Društvo podeljuje najbolj zaslužnim članom Minařikova odličja, od leta 1990 Minařikova priznanja. Priznanja se imenujejo po našem znanem zgodovinarju farmacije prof. Francu Minařiku. Seznam prejemnikov priznanj! Delovanje društva urejajo društveni akti, člane društva zavezuje kodeks farmacevtske etike članov SFD.